平安時代は、怨霊信仰が特に強くなった時代です。安倍晴明(あべのせいめい)に代表される陰陽師(おんみょうじ)が活躍したのもこの時代。
このような平安時代、天皇は大国主の祟りをどう考えたでしょう？

橿原の地から逃げてもダメ、古事記に「今の天皇を祟るのは筋違いです」と書き込んでもダメ、仏教の力に頼ってもダメ。大国主の祟りはパワーアップしています。

こうなったら原点回帰！
「但し、私の住む所は地底の岩に巨大な宮柱を撃ち込み、天つ神が過ごされている高天原まで届く神殿を造って治めて頂ければ、私は『百不足八十坰手』に隠れましょう」

その通りの出雲大社を造ります。結果、「雲太、和二、京三」。

ガイドブックに書かれている通りのことが起こりました。大仏殿の高さは15丈、出雲大社は16丈。測ったように、きっちり1丈高い(1丈は約3m)。てか、測ってます。このことから平安時代の出雲大社は、東大寺大仏殿より後に建てられたことが分かります。

いろんな祟り、特に大国主の祟りを静めるために建立した、奈良の大仏が収まる東大寺大仏殿より、大国主が鎮座する神殿の方が高くなければ意味が無い。

私の妄想に基づくと平安時代、出雲大社が何故、日本一の高さ48mを誇ったのか、明確に説明できるでしょう。
その後、大国主の祟りがどうなったかは、あなたがご判断下さい。私の記憶が確かならば、この後政治の実権は藤原氏に移り、源平合戦の後、いい国作ろう鎌倉幕府、武士の時代が始まります。
再び天皇に実権が戻ってくるのは1867年、大政奉還まで待たなければなりませんでした。